Las asignaturas que se deben cursar para obtener el título de Ingeniera o Ingeniero de Sistemas y Computación de la Javeriana, están organizadas en cuatro componentes principales:

Núcleo de formación fundamental: Comprende las asignaturas de ciencias naturales y matemáticas, las ciencias básicas de ingeniería, las socio-humanísticas y las institucionales (70% del total de los créditos).

Énfasis: Son asignaturas de profundización, se pueden escoger entre: Teoría y Práctica de Modelos Computacionales, Interacción Humano-Computadora y Redes y Comunicaciones (12% del total de créditos). El estudiante debe tomar por lo menos un Énfasis de la Carrera.

Opción Complementaria: Son grupos de asignaturas ofrecidos por otras Carreras de la Universidad para favorecer la interdisciplinariedad, los créditos acumulados pueden servir para obtener un segundo título (8% del total de los créditos).

Electivas Generales: Son asignaturas de libre escogencia del estudiante según sus intereses (8% del total de los créditos).

Esta estructura, altamente flexible e interdisciplinaria, permite un amplio margen de decisión para que, con la ayuda del Consejero Académico, el estudiante pueda complementar los estándares de su formación básica en Ingeniería de Sistemas y Computación, según sus intereses y las oportunidades del mundo profesional, e incluso optar por un segundo título de pregrado.