Entre las principales líneas de investigación se encuentran: psicometría, psicología evolutiva y diferencial, psicología de las organizaciones y neurociencias y neuropsicología. Se detallan a continuación:

1. Psicometría

Enfasis en procesos de medición y estandarización. Cada vez se identifica la necesidad de diseñar procesos estandarizados de validación de pruebas y estandarización de las mismas. De igual forma, es fundamental los procesos de educación frente a temáticas psicométricas. Se buscan los siguientes objetivos:

- Estandarización de los procesos de elaboración y validación de pruebas psicológicas.

- Desarrollo de pedagogías metodológicas en los procesos de medición y estandarización de pruebas.

2. Psicología evolutiva y diferencial

Énfasis en los procesos evolutivos, sus necesidades y problemáticas a lo largo del ciclo evolutivo. Las principales problemáticas relacionadas con los adolescentes y con los adultos mayores se encuentran los factores psicosociales de riesgo, los trastornos psicopatológicos y las condiciones biopsicosociales de la población antes mencionada. Se buscan los siguientes objetivos:

- Identificar las principales problemáticas de los adolescentes colombianos relacionadas con la salud sexual y reproductiva en función de los datos epidemiológicos de las entidades de salud.

- Caracterizar a las personas mayores en sus variables psicosociales como son el deterioro cognitivo, la depresión y la calidad de vida con el fin de diseñar un programa de mejoramiento de las dificultades cognitivas y psicológicas en sus diferentes contextos (hogares y centros de atención).

- Diseñar, implementar y evaluar un programa de intervención biopsicosocial  para la prevención de la infección por el VIH/SIDA y otras enfermedades de transmisión sexual en adolescentes colombianos.

3. Psicología de las organizaciones

Énfasis en las competencias, problemáticas de las personas en el trabajo y la psicología del emprendimiento. Estas líneas entrarían a fortalecer procesos docentes, investigativos y de proyección social contribuyendo al desarrollo de la carrera en el contexto nacional desde una mirada biológica, psicológica y social. Se buscan los siguientes objetivos:

- Identificar las principales competencias que exigen las diferentes organizaciones para la vinculación del psicólogo en contextos laborales.

- Evaluar y desarrollar competencias en estudiantes de Psicología  del campo organizacional de la Pontificia Universidad Javeriana para responder a las demandas del medio laboral.

- Aproximarse a la identificación de cogniciones en los procesos de consumo de productos de las personas del valle del cauca.

4. Neurociencias y Neuropsicología

Énfasis: Consolidar modelos conceptuales del funcionamiento cerebral y sus implicaciones en la función cognitiva. Se buscan los siguientes objetivos:

-Realizar estudios que contribuyan al desarrollo del conocimiento científico de las alteraciones en el funcionamiento cognoscitivo como consecuencia del daño cerebral en la población colombiana, en consecuencia generar estrategias y programas de intervención temprana para casos con secuelas cognitivas del daño cerebral tanto en adultos como en niños.  

-Socializar los resultados de las investigaciones en la comunidad científica con el fin de promover el trabajo interdisciplinario que permita el desarrollo del conocimiento de esta área y se genere un aporte a la comunidad científica, académica y social con  la aplicación de los hallazgos.

-Realizar eventos académicos, científicos que promuevan el desarrollo de la neuropsicología y las neurociencias en la región.